Yapı, 1846 yılında Vatikan’ın İstanbul’daki temsilcisi Monsenyör Hillerau tarafından, Maison du Saint Esprit adıyla, yatılı okul olarak yaptırılmıştır. 1856 yılında yönetim değişmiş ve Notre Dame de Sion Rahibeleri yönetimi devralmıştır. Böylece okul, kız koleji ve yetimhane olarak hizmet vermeye başlamıştır. I. Dünya Savaşı sırasında Fransız rahibeler ülkeyi terk etmiş ve okul kapanmıştır. Okulun kapanmasının ardından bina, mühendislik okulu, hastane gibi farklı işlevlerde hizmet vermiştir. 1919 yılında okul tekrar açılmıştır.

Cumhuriyetin ilanından sonra getirilen yasa ile okuldaki tüm dini simgeler kaldırılmış ve rahibelerin dini kıyafet giymesi yasaklanmıştır. Atatürk'ün manevi kızlarından üçünün bu okulda eğitim gördüğü bilinmektedir. 1996 yılından sonra okula erkek öğrencilerin kabul edilmesiyle okul karma eğitime geçmiştir.

Yapı bölgede inşa edilen ilk binalardandır. Küçük bir avlusu bulunan yapıya farklı dönemlerde eklemeler yapıldığı görülmektedir. Yapının ana binası 3 kattan oluşmaktadır.